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2020 Articolo in rivista open access

Designing a Network Proximity-Based Drug Repurposing Strategy for COVID-19

The ongoing COVID-19 pandemic still requires fast and effective efforts from all fronts, including epidemiology, clinical practice, molecular medicine, and pharmacology. A comprehensive molecular framework of the disease is needed to better understand its pathological mechanisms, and to design successful treatments able to slow down and stop the impressive pace of the outbreak and harsh clinical symptomatology, possibly via the use of readily available, off-the-shelf drugs. This work engages in providing a wider picture of the human molecular landscape of the SARS-CoV-2 infection via a network medicine approach as the ground for a drug repurposing strategy. Grounding on prior knowledge such as experimentally validated host proteins known to be viral interactors, tissue-specific gene expression data, and using network analysis techniques such as network propagation and connectivity significance, the host molecular reaction network to the viral invasion is explored and exploited to infer and prioritize candidate target genes, and finally to propose drugs to be repurposed for the treatment of COVID-19. Ranks of potential target genes have been obtained for coherent groups of tissues/organs, potential and distinct sites of interaction between the virus and the organism. The normalization and the aggregation of the different scores allowed to define a preliminary, restricted list of genes candidates as pharmacological targets for drug repurposing, with the aim of contrasting different phases of the virus infection and viral replication cycle.

COVID-19 network medicine drug repurposing network-based pharmacologic (drug) therapy
2019 Altro metadata only access

Vincitori StartCup Lazio

L'idea imprenditoriale da cui prende origine la start-up ProNeuro, nasce come conseguenza del lavoro di ricerca svolto dai soci fondatori presso il Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR). Questo lavoro ha portato negli ultimi 3 anni al deposito di due domande di brevetto italiano, di cui una già estesa in PCT, che proteggono l'utilizzo della molecola ProNGF-A per scopi terapeutici mirati alla cura di patologie neurologiche e infiammatorie (domanda di brevetto Nr. 102018000003279 del 05/03/2018 e PCT/IB2019/051753 del 05/03/2019) e la produzione di una forma mutata di ProNGF-A e il suo utilizzo per terapia neurologica e di patologie cutanee (domanda di brevetto numero 102019000014646 del 12/08/2019). Tali brevetti sono di proprietà del CNR, mentre ProNeuro ha messo a punto un sistema di offerta finalizzato alla loro valorizzazione. Attraverso attività di Ricerca e Sviluppo, ProNeuro individua principi attivi farmacologici con attività protettiva e riparativa per il sistema nervoso, ne modifica la struttura per renderli maggiormente efficaci, sicuri e biocompatibili, mette a punto i metodi produttivi ed esegue le prime fasi di caratterizzazione dei loro effetti, prima di proporli ad aziende farmaceutiche per un successivo sviluppo come farmaci destinati al mercato. ProNeuro commercializza, quindi, i diritti di utilizzo della proprietà intellettuale e una serie di prodotti collegati alle attività di discovery, produzione (trasferimento tecnologico) e prima validazione sia predittiva che biologica di nuovi neurofarmaci. ProNeuro avrà la forma giuridica di Società a responsabilità limitata e si configura come spin-off CNR. Come tale, il rapporto tra la società ProNeuro e il CNR è regolato dal "Regolamento per la costituzione e la partecipazione del CNR alle Imprese Spin off, Del,18/2019". I brevetti sopracitati, attualmente di proprietà del CNR, verranno concessi in licenza a ProNeuro, con possibilità di sub-licenziare a terzi, sulla base del suddetto Regolamento. Questo prevede, infatti, la cessione a condizioni agevolate delle licenze sui brevetti di proprietà CNR, la messa a disposizione di risorse logistiche e strumentali in fase di start-up e l'autorizzazione al proprio personale a svolgere attività a favore delle spin-off, con copertura dei costi salariali per un terzo del tempo lavorativo per tre anni. La sede dell'impresa è stata individuata presso l'Istituto di Farmacologia Traslazionale del CNR, via del Fosso del Cavaliere 100, 00133 Roma

ProNeuro NGF proNGF
2019 Articolo in rivista restricted access

The greater inflammatory pathway-high clinical potential by innovative predictive, preventive, and personalized medical approach

Maturo Maria Giovanna ; Soligo Marzia ; Gibson Greg ; Manni Luigi ; Nardini Christine

Background and limitations Impaired wound healing (WH) and chronic inflammation are hallmarks of non-communicable diseases (NCDs). However, despite WH being a recognized player in NCDs, mainstream therapies focus on (un)targeted damping of the inflammatory response, leaving WH largely unaddressed, owing to three main factors. The first is the complexity of the pathway that links inflammation and wound healing; the second is the dual nature, local and systemic, of WH; and the third is the limited acknowledgement of genetic and contingent causes that disrupt physiologic progression of WH. Proposed approach Here, in the frame of Predictive, Preventive, and Personalized Medicine (PPPM), we integrate and revisit current literature to offer a novel systemic view on the cues that can impact on the fate (acute or chronic inflammation) of WH, beyond the compartmentalization of medical disciplines and with the support of advanced computational biology. Conclusions This shall open to a broader understanding of the causes for WH going awry, offering new operational criteria for patients' stratification (prediction and personalization). While this may also offer improved options for targeted prevention, we will envisage new therapeutic strategies to reboot and/or boost WH, to enable its progression across its physiological phases, the first of which is a transient acute inflammatory response versus the chronic low-grade inflammation characteristic of NCDs.

Predictive preventive and personalized medicine Wound healing Inflammation Non-communicable diseases Mechanotransduction Network science Multi-omics Neuro-immuno modulation Autonomic nervous system Genetics Epigenetics Patient stratification Individualized patient profile Risk modifiable preventable factors Big data analysis Machine learning Phenotyping